技術服務
Technical service
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RNA親和純化測序（RAP-seq）
與RIP-seq（RNA免疫共沉淀測序）相比，RAP-seq無需特異抗體性，無需遺傳轉化，高效鑒定RNA結合蛋白與RNA的相互作用，助力RNA結合蛋白（RBP）調控機制研究
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RNA凝膠遷移或電泳遷移率實驗（RNA-EMSA）
RNA-EMSA（RNA-Electrophoretic Mobility Shift Assay）是一種快速靈敏的檢測蛋白-RNA互作的技術方法，RNA-EMSA是將標記的RNA與蛋白質共同孵育，當形成復合物后，通過非變性聚丙烯酰胺凝膠對RNA-蛋白質復合體進行電泳。 與游離的RNA探針相比，RNA-蛋白質復合體的遷移速度較慢，可以在凝膠上觀察到阻滯條帶。通過RNA-EMSA實驗可以檢測或驗證RNA與蛋白質的相互作用、蛋白質在RNA上的結合序列等。
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RNA Pull Down
RNA Pull Down是根據已知的RNA序列，設計DNA模板，然后使用體外轉錄技術合成生物素標記的RNA探針，并與蛋白提取液進行孵育，形成RNA-蛋白質復合體。
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體內RNA親和純化（RAP）
體內RNA親和純化（RNA Affinity Purification，RAP）是根據感興趣的已知RNA序列，設計與RNA序列互補的生物素標記的DNA捕獲探針，同時將RNA與蛋白質在體內進行交聯，然后使用DNA捕獲探針，將與目的RNA結合的復合物沉淀下來，進行LC-MS/MS檢測，鑒定出目的RNA的結合蛋白。
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RNA免疫共沉淀測序（RIP-seq）
RNA免疫共沉淀測序（RNA Immunoprecipitation Sequencing, RIP-seq）是研究細胞內RNA與蛋白質結合的技術。原理是利用目標蛋白的特異性抗體，將對應的蛋白-RNA復合體進行免疫沉淀，對分離純化的RNA進行建庫與高通量測序。
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