
- 技術(shù)簡介
- 服務(wù)流程
- 實驗結(jié)果
ATAC-seq (Assay for Transposase Accessible Chro-matin with high-throughput sequencing)是一種在全基因組范圍內(nèi)檢測染色質(zhì)的開放程度的組學(xué)技術(shù),可以得到全基因組范圍內(nèi)的蛋白質(zhì)可能結(jié)合的位點信息。
其原理是利用轉(zhuǎn)座酶Tn5容易結(jié)合在開放染色質(zhì)的特性,對Tn5酶捕獲到的DNA序列進行測序。該技術(shù)可用于分析開放的染色質(zhì)區(qū)域上可能結(jié)合的潛在調(diào)控蛋白(如:轉(zhuǎn)錄因子和輔因子),用此方法與其他方法結(jié)合篩查感興趣的特定調(diào)控因子。

原文鏈接:
Transposition_of_native_chromatin_for_fast_and_sensitive_epigenomic_profiling_of.pdf



Peak在TSS附近的分布 Peak 中心信號分布圖曲線圖


Peak在染色體上的分布 Peak在基因功能區(qū)的分布


GO富集分析 KEGG富集分析


Motif分析 ATAC-seq與RNA-seq聯(lián)合分析Venn圖







